Do hoạt động địa chất tại Nhật Bản, mà các mối nguy hiểm tự nhiên có rất nhiều. Nhưng động đất là hiểm hoạ đe doạ tính mạng nhiều nhất. Vì địa chất Nhật Bản dù chỉ nằm một phần nhỏ thuộc vành đai núi lửa Thái Bình Dương, nên phải hứng chịu những cơn thịnh nộ từ mẹ thiên nhiên. Có nhiều núi lửa đang hoạt động. Mỗi năm có từ 500 đến 1.000 trận động đất có thể xảy ra. Nhưng chỉ một số ít là gây thiệt hại về người hoặc tài sản. Trung tâm của các trận động đất thường xảy ra ngoài biển, dọc theo khu vực kiến tạo chìm dưới đáy biển; và dọc theo các vùng đứt đoạn, chạy dài lên trung tâm của đảo Kyushu, Honshu và Hokkaido. Khi mà động đất xảy ra ngoài khơi, năng cao sẽ có sóng thần (tiếng nhật gọi là tsunami).