הקריירה של פרופ׳ אייל שוורצברג כללה ניהול שירותי רוקחות בבית החולים הלל יפה בחדרה, ראש מערך הרוקחות במשרד הבריאות, סמנכ״ל בבית חולים איכילוב, ומשרות יעוץ שונות. כיום הוא משמש מרצה באונ׳ בן גוריון ובאונ׳ לונג איילנד. פרופ׳ שוורצברג מייסד ומנהל את חברת ApoWiser שמביאה את בשורת האוטומציה והבינה המלאכותית לשוק התרופות והבריאות